cy3-N3菁染料标记叠氮是一种活性染料，可以用于点击化学。除此cy3还可标记氨基NH2、羧基COOH、马来酰亚胺MAL、生物素Biotin，炔基Alk，叠氮N3等等。非磺化的产品，需要如DMF，DMSO或其他有机溶剂共溶剂来在水中进行标记。