CY5-NHS菁染料标记活性酯是一种活性染料，用于标记含氨基的肽、蛋白质和寡核苷酸中的氨基。除此CY5还可修饰氨基NH2、羧基COOH、马来酰亚胺MAL、生物素Biotin，炔基Alk，叠氮N3等不同活性基团。